Als het vermogen om lichaamsvreemde structuren te herkennen tekort schiet, spreken we van een afweerstoornis of immuundeficientie. Dit kan leiden tot infecties.
Afweerstoornissen kunnen onderverdeeld worden in:
primaire en secundaire afweerstoornissen.
Daarnaast kunnen afweerstoornissen ook nog onderverdeeld worden in:
aangeboren (dus al bij de geboorte aanwezig) en
verworven (in de loop van het leven ontstaan) afweerstoornissen.